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Este estudio utiliza un modelo basado en agentes para simular la progresión de la fibrosis pulmonar idiopática y evaluar la eficacia de tratamientos con pirfenidona y pentoxifilina, con el objetivo de mejorar la comprensión de la enfermedad y apoyar la toma de decisiones terapéuticas.
Este estudio demuestra que los quimiotipos derivados de la espectroscopía FTIR y el aprendizaje automático en *Drosophila melanogaster* actúan como predictores integradores de la variación genotípica, fisiológica y de la respuesta al estrés, ofreciendo una representación computable del estado biológico del organismo.
Este estudio establece un marco de procedimientos operativos estandarizados para la proteómica de carne cultivada, demostrando que la optimización de los protocolos de preparación de muestras y el uso de adquisición independiente de datos (DIA) permiten obtener una cobertura proteómica profunda y comparable, esencial para la caracterización integral y la futura regulación del sector.
El estudio presenta BARMIX, una plataforma que combina experimentos multiplexados con células tumorales de GIST etiquetadas con códigos de ADN y un marco probabilístico para cuantificar de manera eficiente y precisa la resistencia al tratamiento en múltiples genotipos simultáneamente, facilitando así el desarrollo de terapias de precisión.
Este estudio presenta métodos numéricos para identificar bandas de resonancia en motores de vuelo insecto con elasticidad distribuida, revelando que dicha distribución es una estrategia morfológica de alto riesgo y alta recompensa que, si está bien ajustada, puede ampliar la banda de resonancia más de cuatro veces, mejorando así la eficiencia y la maniobrabilidad del vuelo.
Este estudio presenta el primer modelo metabólico a escala genómica basado en el pangenoma de *Xylella fastidiosa* (Xfcore), el cual no solo guía la formulación de medios de cultivo definidos y revela una vía metabólica inédita para el uso de acetato, sino que también identifica y valida experimentalmente la producción de poliaminas como un nuevo factor de virulencia potencial en este patógeno.
El artículo presenta GlycoDiveR, un marco de trabajo modular en R de código abierto diseñado para estandarizar, analizar y visualizar datos de glicoproteómica de alta dimensionalidad, superando las limitaciones de las herramientas actuales al ofrecer una arquitectura flexible que facilita la exploración de la microheterogeneidad de glicanos sin requerir conocimientos avanzados de programación.
Este estudio integra secuenciación genómica y perfiles inmunológicos longitudinales en 101 individuos sanos para revelar tres inmunotipos reproducibles asociados a perfiles metabólicos e inflamatorios específicos, así como variantes genéticas que influyen en la heterogeneidad basal del sistema inmunitario humano.
Este estudio demuestra que el marco computacional TransComp-R mejora la utilidad de los modelos murinos para la enfermedad de Alzheimer de inicio tardío al identificar características transcriptómicas conservadas que permitieron descubrir y validar el potencial terapéutico del suvorexante, un antagonista del receptor de orexina, para reducir los niveles de tau fosforilada en humanos.
Mediante un modelo computacional y el análisis de datos genómicos, este estudio demuestra que la deriva del sistema de desarrollo es un fenómeno generalizado en la evolución del desarrollo de meristemas vegetales, donde las interacciones regulatorias esenciales cambian y se reconfiguran continuamente sin alterar el fenotipo conservado.
Este estudio integra modelos metabólicos de escala metagenómica y metabolómica para revelar que, aunque la microbiota del ficosfera de *Microcystis* amplía y diversifica el repertorio metabólico del sistema de forma independiente a la filogenia de la cianobacteria, los perfiles metabolómicos están impulsados principalmente por los outputs metabólicos de la cianobacteria, lo que subraya la importancia ecológica de las interacciones metabólicas interespecíficas en la estructuración de las comunidades asociadas a las floraciones algales.
Este estudio utiliza un modelo matemático para demostrar que los polifosfatos liberados por las plaquetas aceleran la generación de trombina en la coagulación iniciada por factor tisular bajo flujo, reduciendo la umbral de densidad de factor tisular necesario para desencadenar una respuesta y disminuyendo la sensibilidad del proceso a la inhibición por el inhibidor de la vía del factor tisular (TFPI).
El artículo presenta FASTERCC, una versión optimizada de FASTCC que aprovecha información estructural para acelerar drásticamente la prueba de consistencia de flujo y la reconstrucción de redes metabólicas a gran escala, reduciendo los tiempos de ejecución hasta en un 20 veces en comparación con el método original.
Este estudio identifica firmas moleculares circulantes compuestas por microARNs y proteínas que predicen con alta precisión los resultados clínicos divergentes en niños con miocardiopatía dilatada, ofreciendo un potencial biomarcador para la estratificación temprana del riesgo y la gestión personalizada.
El artículo presenta X-Cell, un modelo de lenguaje difusivo escalable entrenado en el mayor compendio de datos de perturbación genética (X-Atlas/Pisces) hasta la fecha, que logra predecir con alta precisión las respuestas transcripcionales a perturbaciones en diversos contextos celulares mediante la integración de conocimientos biológicos multimodales y el cumplimiento de leyes de potencia en el escalado de parámetros.
Mediante simulaciones de control óptico estocástico en un modelo musculoesquelético detallado, este estudio demuestra que el nivel de ruido sensorimotor moldea la variabilidad de la marcha y la actividad muscular, revelando que la minimización del esfuerzo subyace a la estrategia de control que prioriza la estabilidad del centro de masa y la seguridad del pie sobre la variabilidad de los ángulos articulares.
Este estudio presenta un marco computacional de física múltiple que acopla simulaciones de interacción fluido-estructura con un modelo de biología de sistemas para demostrar cómo las fuerzas hemodinámicas y la señalización bioquímica interactúan bidireccionalmente para impulsar la calcificación de la válvula aórtica.
Este estudio presenta un modelo computacional que demuestra cómo la adaptación de los tumores al microambiente óseo reduce su dependencia de factores de crecimiento derivados del hueso, lo que explica por qué la inhibición de la resorción ósea es eficaz para detener el crecimiento de tumores no adaptados pero insuficiente para controlar los tumores ya adaptados.
Este estudio demuestra que las dietas altas en grasas provocan una reprogramación multi-ómica persistente en el huésped y el microbioma que, aunque parcialmente reversible, deja una "memoria" duradera de alteraciones específicas incluso después de volver a una dieta control.
Este estudio presenta BIRDkiss, un marco de modelado mecanístico y de código abierto que integra presupuestos energéticos y toxicocinética/toxicodinámica para predecir de manera robusta cómo la exposición a pesticidas y la disponibilidad de alimentos afectan el crecimiento y la reproducción de las aves, permitiendo evaluar riesgos tanto para compuestos individuales como para mezclas químicas en escenarios realistas.